PLPR_verifiedMOD.seq: Final Core-Matrix for    251 SEQs (out of    576)

  0.120  0.096  0.004  0.000  0.044  0.052  0.092  0.120  0.012  0.060
  0.195  0.375  0.020  0.932  0.044  0.422  0.606  0.335  0.056  0.653
  0.064  0.048  0.000  0.008  0.000  0.052  0.024  0.044  0.012  0.068
  0.622  0.482  0.976  0.060  0.912  0.474  0.279  0.502  0.920  0.219



PLPR_verifiedMOD.seq: Final Extended Matrix for    251 SEQs (out of    576)

  0.299  0.255  0.243  0.291  0.120  0.096  0.004  0.000  0.044  0.052  0.092  0.120  0.012  0.060  0.251  0.255  0.223  0.279
  0.223  0.263  0.295  0.303  0.195  0.375  0.020  0.932  0.044  0.422  0.606  0.335  0.056  0.653  0.251  0.291  0.351  0.259
  0.131  0.124  0.112  0.092  0.064  0.048  0.000  0.008  0.000  0.052  0.024  0.044  0.012  0.068  0.116  0.120  0.076  0.080
  0.347  0.359  0.351  0.315  0.622  0.482  0.976  0.060  0.912  0.474  0.279  0.502  0.920  0.219  0.382  0.359  0.378  0.331

____________________________________________________________

PLPR_verifiedMOD_tata.seq: Final Core-Matrix for    152 SEQs (out of    345)

  0.105  0.112  0.007  0.000  0.039  0.079  0.072  0.151  0.013  0.086
  0.204  0.382  0.020  0.921  0.053  0.368  0.671  0.375  0.026  0.586
  0.059  0.059  0.000  0.007  0.000  0.033  0.026  0.039  0.013  0.092
  0.632  0.447  0.974  0.072  0.908  0.520  0.230  0.434  0.947  0.237



PLPR_verifiedMOD_tata.seq: Final Extended Matrix for    152 SEQs (out of    345)

  0.336  0.243  0.289  0.375  0.105  0.112  0.007  0.000  0.039  0.079  0.072  0.151  0.013  0.086  0.283  0.237  0.237  0.309
  0.197  0.243  0.296  0.224  0.204  0.382  0.020  0.921  0.053  0.368  0.671  0.375  0.026  0.586  0.217  0.316  0.329  0.243
  0.132  0.145  0.105  0.079  0.059  0.059  0.000  0.007  0.000  0.033  0.026  0.039  0.013  0.092  0.125  0.125  0.079  0.066
  0.336  0.368  0.309  0.322  0.632  0.447  0.974  0.072  0.908  0.520  0.230  0.434  0.947  0.237  0.375  0.342  0.382  0.336

____________________________________________________________

PLPR_verifiedMOD_tataless.seq: Final Core-Matrix for    108 SEQs (out of    231)

  0.148  0.074  0.000  0.009  0.065  0.046  0.102  0.093  0.019  0.028
  0.231  0.370  0.009  0.907  0.037  0.398  0.546  0.278  0.083  0.741
  0.037  0.046  0.009  0.019  0.000  0.083  0.019  0.046  0.019  0.037
  0.583  0.509  0.981  0.065  0.898  0.472  0.333  0.583  0.880  0.194



PLPR_verifiedMOD_tataless.seq: Final Extended Matrix for    108 SEQs (out of    231)

  0.278  0.278  0.194  0.148  0.148  0.074  0.000  0.009  0.065  0.046  0.102  0.093  0.019  0.028  0.213  0.287  0.139  0.241
  0.269  0.269  0.269  0.426  0.231  0.370  0.009  0.907  0.037  0.398  0.546  0.278  0.083  0.741  0.306  0.278  0.361  0.250
  0.111  0.120  0.157  0.139  0.037  0.046  0.009  0.019  0.000  0.083  0.019  0.046  0.019  0.037  0.102  0.093  0.093  0.111
  0.343  0.333  0.380  0.287  0.583  0.509  0.981  0.065  0.898  0.472  0.333  0.583  0.880  0.194  0.380  0.380  0.435  0.333

____________________________________________________________

PLPR_verified_dicotMOD.seq: Final Core-Matrix for    211 SEQs (out of    403)

  0.085  0.090  0.019  0.009  0.052  0.062  0.076  0.133  0.019  0.071
  0.128  0.374  0.014  0.872  0.028  0.294  0.682  0.322  0.038  0.536
  0.033  0.052  0.009  0.009  0.009  0.052  0.014  0.038  0.009  0.076
  0.754  0.483  0.957  0.109  0.910  0.592  0.227  0.507  0.934  0.318



PLPR_verified_dicotMOD.seq: Final Extended Matrix for    211 SEQs (out of    403)

  0.336  0.299  0.242  0.275  0.085  0.090  0.019  0.009  0.052  0.062  0.076  0.133  0.019  0.071  0.256  0.289  0.242  0.275
  0.185  0.232  0.270  0.332  0.128  0.374  0.014  0.872  0.028  0.294  0.682  0.322  0.038  0.536  0.199  0.294  0.308  0.237
  0.104  0.133  0.147  0.095  0.033  0.052  0.009  0.009  0.009  0.052  0.014  0.038  0.009  0.076  0.104  0.095  0.081  0.081
  0.374  0.336  0.341  0.299  0.754  0.483  0.957  0.109  0.910  0.592  0.227  0.507  0.934  0.318  0.441  0.355  0.389  0.355

____________________________________________________________

PLPR_verified_dicotMOD_tata.seq: Final Core-Matrix for    137 SEQs (out of    256)

  0.095  0.117  0.022  0.000  0.029  0.058  0.051  0.109  0.015  0.095
  0.182  0.350  0.015  0.898  0.036  0.307  0.701  0.387  0.022  0.504
  0.044  0.080  0.022  0.007  0.007  0.036  0.022  0.051  0.015  0.102
  0.679  0.453  0.942  0.095  0.927  0.599  0.226  0.453  0.949  0.299



PLPR_verified_dicotMOD_tata.seq: Final Extended Matrix for    137 SEQs (out of    256)

  0.343  0.263  0.299  0.372  0.095  0.117  0.022  0.000  0.029  0.058  0.051  0.109  0.015  0.095  0.248  0.270  0.270  0.307
  0.175  0.234  0.255  0.219  0.182  0.350  0.015  0.898  0.036  0.307  0.701  0.387  0.022  0.504  0.197  0.299  0.277  0.204
  0.117  0.146  0.124  0.088  0.044  0.080  0.022  0.007  0.007  0.036  0.022  0.051  0.015  0.102  0.131  0.117  0.066  0.088
  0.365  0.358  0.321  0.321  0.679  0.453  0.942  0.095  0.927  0.599  0.226  0.453  0.949  0.299  0.423  0.336  0.416  0.350

____________________________________________________________

PLPR_verified_dicotMOD_tataless.seq: Final Core-Matrix for     83 SEQs (out of    147)

  0.048  0.108  0.000  0.036  0.084  0.060  0.120  0.084  0.024  0.048
  0.133  0.398  0.000  0.795  0.036  0.229  0.506  0.265  0.084  0.735
  0.012  0.024  0.024  0.036  0.000  0.072  0.024  0.012  0.012  0.060
  0.807  0.470  0.976  0.133  0.880  0.639  0.349  0.639  0.880  0.157



PLPR_verified_dicotMOD_tataless.seq: Final Extended Matrix for     83 SEQs (out of    147)

  0.301  0.373  0.229  0.157  0.048  0.108  0.000  0.036  0.084  0.060  0.120  0.084  0.024  0.048  0.241  0.337  0.133  0.265
  0.265  0.265  0.241  0.422  0.133  0.398  0.000  0.795  0.036  0.229  0.506  0.265  0.084  0.735  0.265  0.253  0.301  0.253
  0.084  0.072  0.133  0.108  0.012  0.024  0.024  0.036  0.000  0.072  0.024  0.012  0.012  0.060  0.096  0.096  0.120  0.096
  0.349  0.289  0.398  0.313  0.807  0.470  0.976  0.133  0.880  0.639  0.349  0.639  0.880  0.157  0.398  0.349  0.458  0.337

____________________________________________________________

PLPR_verified_monocotMOD.seq: Final Core-Matrix for     52 SEQs (out of    150)

  0.096  0.019  0.000  0.000  0.154  0.038  0.038  0.135  0.000  0.038
  0.538  0.692  0.038  0.962  0.385  0.346  0.750  0.596  0.019  0.923
  0.154  0.077  0.019  0.000  0.019  0.135  0.077  0.096  0.038  0.000
  0.212  0.212  0.942  0.038  0.442  0.481  0.135  0.173  0.942  0.038



PLPR_verified_monocotMOD.seq: Final Extended Matrix for     52 SEQs (out of    150)

  0.192  0.115  0.154  0.250  0.096  0.019  0.000  0.000  0.154  0.038  0.038  0.135  0.000  0.038  0.154  0.269  0.115  0.192
  0.346  0.423  0.519  0.288  0.538  0.692  0.038  0.962  0.385  0.346  0.750  0.596  0.019  0.923  0.346  0.346  0.385  0.212
  0.192  0.173  0.154  0.192  0.154  0.077  0.019  0.000  0.019  0.135  0.077  0.096  0.038  0.000  0.173  0.115  0.154  0.173
  0.269  0.288  0.173  0.269  0.212  0.212  0.942  0.038  0.442  0.481  0.135  0.173  0.942  0.038  0.365  0.269  0.423  0.308

____________________________________________________________

PLPR_verified_monocotMOD_tata.seq: Final Core-Matrix for     30 SEQs (out of     84)

  0.067  0.000  0.000  0.000  0.233  0.033  0.100  0.200  0.000  0.000
  0.400  0.667  0.067  1.000  0.267  0.467  0.700  0.533  0.033  0.967
  0.200  0.067  0.033  0.000  0.033  0.100  0.100  0.167  0.033  0.000
  0.333  0.267  0.900  0.000  0.467  0.400  0.100  0.100  0.933  0.033



PLPR_verified_monocotMOD_tata.seq: Final Extended Matrix for     30 SEQs (out of     84)

  0.233  0.200  0.167  0.367  0.067  0.000  0.000  0.000  0.233  0.033  0.100  0.200  0.000  0.000  0.233  0.233  0.133  0.133
  0.300  0.333  0.533  0.133  0.400  0.667  0.067  1.000  0.267  0.467  0.700  0.533  0.033  0.967  0.267  0.333  0.400  0.300
  0.200  0.133  0.167  0.100  0.200  0.067  0.033  0.000  0.033  0.100  0.100  0.167  0.033  0.000  0.233  0.167  0.100  0.133
  0.267  0.333  0.133  0.400  0.333  0.267  0.900  0.000  0.467  0.400  0.100  0.100  0.933  0.033  0.300  0.267  0.433  0.333

____________________________________________________________

PLPR_verified_monocotMOD_tataless.seq: Final Core-Matrix for     30 SEQs (out of     66)

  0.133  0.100  0.000  0.000  0.000  0.000  0.033  0.033  0.000  0.033
  0.533  0.333  0.033  0.967  0.067  0.567  0.567  0.367  0.200  0.767
  0.067  0.200  0.000  0.033  0.000  0.133  0.033  0.167  0.033  0.100
  0.267  0.367  0.967  0.000  0.933  0.300  0.367  0.433  0.767  0.100



PLPR_verified_monocotMOD_tataless.seq: Final Extended Matrix for     30 SEQs (out of     66)

  0.233  0.067  0.167  0.167  0.133  0.100  0.000  0.000  0.000  0.000  0.033  0.033  0.000  0.033  0.133  0.133  0.200  0.200
  0.333  0.533  0.367  0.300  0.533  0.333  0.033  0.967  0.067  0.567  0.567  0.367  0.200  0.767  0.367  0.400  0.433  0.300
  0.233  0.233  0.233  0.100  0.067  0.200  0.000  0.033  0.000  0.133  0.033  0.167  0.033  0.100  0.233  0.133  0.167  0.167
  0.200  0.167  0.233  0.433  0.267  0.367  0.967  0.000  0.933  0.300  0.367  0.433  0.767  0.100  0.267  0.333  0.267  0.267

____________________________________________________________